Sinüs dokularının iltihaptan arındırılması işlemi olan sinüzit ameliyatı oldukça ayrıntılı bir süreç gerektirmektedir. Sinüzit problemine neden faktörler sinüs ve kafa kemiklerindeki anatomik problemler ise birtakım traşlama işlemleri de gerçekleştirilmektedir. Hastadan hastaya değişmekle birlikte ameliyat yaklaşık 1 saat sürmektedir. Ameliyat sonrasında bölgeye özel tamponlar yerleştirilmektedir.